Atendiendo a los factores geográficos (clima, hidrología, vegetación y aspectos geomorfológicos y litológicos), el territorio comarcal está distribuido en torno a las fértiles vegas de los ríos Alcanadre, Isuala, Vero y Cinca, entre otros, mientras que las mayores elevaciones se alcanzan en la Sierra de Guara, Balcés Sevil, Estadilla y Naval. Encontramos en él dos regiones biogeográficas: la región mediterránea en casi todo el territorio, y la región alpina, en la parte norte en las máximas altitudes de la Sierra de Guara. Esta Comarca ofrece una geomorfología muy variada que condiciona la presencia de microclimas diferentes y gran diversidad de vegetación y fauna. Todo ello, unido a su riqueza en elementos culturales, proporciona diversidad ecológica y una gran riqueza medioambiental.
El territorio del Somontano puede ser caracterizado en tres unidades agroclimáticas y orográficas distintas:
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Somontano Montañoso: Esta región se ubica al pie de las Sierras Exteriores Pirenaicas y comprende parte del Parque Natural de la Sierra y los Cañones de Guara. Aquí se encuentran las sierras de Guara, Arangol, Balcés, Sevil, la serranía Colungo-Naval, y las sierras de Estadilla. Los materiales eocenos predominantes incluyen margas, conglomerados y calizas, dando lugar a un modelado kárstico notable, con formaciones como lapiaces, crestas agudas y complejos sistemas de drenaje subterráneo. Estos procesos han generado características únicas como los cañones, barrancos y desfiladeros que atraen a turistas para actividades de aventura. En términos agrícolas, destacan los cultivos leñosos, como olivares, almendros y viñedos, y en las zonas más altas de la Sierra de Guara, la precipitación anual puede alcanzar los 1.000 mm, superando la media de la comarca.
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Somontano Centro o de Transición: Esta área se encuentra entre la Sierra de Guara y la autovía A-22, caracterizada por materiales oligocenos y un relieve más suave. Aquí, la agricultura es predominante, con mayor énfasis en cultivos leñosos y cereales. Destaca especialmente la extensa área dedicada al viñedo, base de la industria vitivinícola bajo la Denominación de Origen Protegido "Somontano".
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Somontano Monegrino o Llano: Esta zona del sur de la Comarca es más seca y limita con las llanuras esteparias de los Monegros. Su paisaje desértico ha sido alterado por el riego y muestra cerros testigo junto a valles de fondo plano. En esta área, se encuentran formaciones geológicas únicas como el Lugar de Interés Comunitario "Yesos de Barbastro", con relieves estructurales marcados por yesos oligocenos, margas y areniscas plegadas en forma de anticlinal. Además, se destacan otras formaciones como las "muelas" de Terreu, Monte Odina y los sasos de El Tormillo, pliegues anticlinales sobre materiales miocenos afectados por una falla inversa.